In 2003/2004 is de watertoren van Baarn in opdracht van toenmalig eigenaar Hydron (een van de rechtsvoorgangers van het huidige waterbedrijf Vitens) gerestaureerd.
Tijdens de restauratie is de ijzeren draagconstructie van het reservoir vernieuwd. Dit was er slecht aan toe door de temperatuurwisselingen van het water. Hiervoor werd een stalen hulpconstructie met 32 stempels in de toren gebracht om het gewicht van de stenen omhulling (de kroon) tijdelijk te dragen. Op elke stempel rustte 2.800 kg, in totaal het gewicht van ca. 90.000 kg. Het reservoir zelf hoefde niet ondersteund te worden, dat rust op de schacht van de toren. Ook is metselwerk en natuursteen gerepareerd dan wel vervangen en zijn de stalen ramen geconserveerd. De antieke windvaan – met het bouwjaar 1903 – is opnieuw verguld en de muurankers zijn gerestaureerd. Om dit alles mogelijk te maken werd een steiger met ‘verdiepingen’ rond de toren gebouwd die met doek werd ingepakt tegen vallend gesteente.